主菜单选完关卡进去之前，右下角有个小齿轮图标，点开能看到当前章节的分支预览，灰色的就是还没解锁的路线。流行之神2一共12个主线章节，每章至少2条分支，多的能到4条，全通关需要刷23个结局。
核心机制是选项累积制，不是单次选择定生死。每章有5到8个关键选项，选项带来的”倾向值”是隐藏数值，到章节末尾系统按累积分数判定走哪条线。比如第3章《诅咒的人偶》，选择”相信灵异说法”类选项3次以上进超自然线，选”寻找物证”类选项4次以上进推理线，两边都不够就进普通结局。
第一周目建议按剧本推荐顺序打，游戏会在章节选择界面标”recommended”。推荐线都是中庸选项，不会错过主线剧情，通关后解锁快进和章节跳转功能。第二周目开始刷分支，这时候回到已通关章节，所有选项都能直接看到对应的倾向标签，红色是灵异倾向、蓝色是科学倾向、灰色是中立。
刷隐藏结局要满足前置条件。第7章《消失的新娘》的真相线必须先通关第4章和第6章的推理分支，第11章《都市传说的尽头》的完美结局要求前10章至少拿到18个结局。这些前置没达成的话，就算选项全选对，章节结尾也只会跳普通结局，系统不会提示你缺前置。
有3个章节的分支判定比较绕。第5章《地下铁的哭声》需要在前半段连续选3次”跟踪可疑人物”才能开启追踪线，中间选一次”报警”就直接锁死普通线。第9章《镜中的访客》要在调查阶段收集到4个以上线索道具，漏掉任何一个互动点都会导致推理线进不去。第12章最终话有个隐藏选项，必须在倒计时3秒内按L1+R1组合键才会出现，错过就是bad end。
23个结局里有5个需要特定道具。这些道具在章节内以”？”标记的互动点获得，不调查就拿不到，拿不到对应结局就出不来。第8章的护身符要在神社场景左侧石灯笼处调查3次，第10章的日记残页要在公寓楼梯间垃圾桶里翻。
全结局通关后主菜单会解锁制作人访谈和设定集，访谈里会标注哪些章节参考了真实都市传说原型，设定集能看到废案分支的文本。