《剑网3》任务系统分为主线、门派、日常和奇遇四大类，新账号从稻香村教学开始，20级前主线任务串联地图开荒，25级后门派任务解锁心法和经脉，满级前所有主线任务经验总和约为120万点，可将角色推至85级左右。主线任务在任务追踪面板中以金色图标标注，支线任务为蓝色图标，两者都绑定角色等级和前置任务完成度，跳过前置会导致后续任务链无法触发。
稻香村教学持续15分钟，涵盖移动、战斗、采集和轻功四项操作，完成后获得10级装备礼盒和2000点经验。离开稻香村后进入所选门派地图，此时主线任务分为”九天篇”和门派专属任务两条线，九天篇需要连续完成8个任务节点才能解锁第一个副本”战宝大殿”，门派任务则在20级时自动接取，包含3次师父对话和5场切磋战，完成后开放门派技能第二页。这两条线的经验收益比为6:4，优先推进九天篇可更快达到副本等级要求。
35级到60级区间主线任务密度降低，平均每5级出现一个任务集群，此时需要配合每日任务补充经验。每日任务分为门派日常（经验2500点/次，每天5次）、帮会日常（经验3000点/次，需要加入帮会）和世界事件（不定期刷新，经验5000-8000点），三类任务不共享次数。门派日常在各门派主城NPC处接取，帮会日常需要帮会等级达到2级才开放全部任务位，世界事件通过区域公告提示，进入指定地图后自动接取。60级之后主线任务恢复密集，每个地图的任务链长度在15-20环，完成一张地图的全部主线可获得该地图的传送权限和声望奖励。
根据2023年重制版更新公告，奇遇任务触发条件已从”随机概率”改为”前置任务+特定坐标停留”，角色需完成对应地图的主线任务第10环以上，并在指定坐标范围内停留30秒以上才会触发奇遇对话。
这意味着奇遇任务不再依赖运气，而是需要玩家主动前往触发点。常见奇遇触发坐标包括扬州城东市（坐标X:1200 Y:850）、洛阳天街（坐标X:2100 Y:1450）和长安西市（坐标X:3400 Y:2200），每个奇遇任务完成后给予橙色装备或心法秘籍，但同一奇遇7天内只能触发一次。奇遇任务不占用任务栏位，可与主线任务同时进行，部分奇遇需要组队完成，任务面板会标注”建议3人”或”建议5人”。
支线任务不影响主线进度，但部分支线关联地图解锁和声望获取。例如枫华谷地图的12个支线任务完成后，开放该地图的隐藏商人和稀有材料采集点，稻香村的8个支线任务完成后，解锁稻香村声望兑换列表中的橙色配方。支线任务经验收益为同级主线任务的40%，时间成本较高，建议优先完成带有”声望”或”解锁”标签的支线，其余支线可在满级后回头补做。任务日志中可通过筛选功能隐藏已完成任务，避免任务栏过载。
满级后主线任务转为”资料片剧情”模式，每个资料片包含30-50环任务，完成后解锁对应版本的团队副本和装备兑换。资料片任务无等级限制，但部分任务需要装备分达到特定数值才能接取，例如”世外蓬莱”资料片要求装备分7000以上。任务自动追踪功能可在设置中开启，路径规划会优先显示传送点和飞行航线，减少跑图时间。